Tandis que Matt enquête sur la mort d'un des Heroes, un autre est attaqué par une nouvelle force qui pourchasse les personnes hors du commun.
Les efforts de Claire pour cacher ses capacités de régénération dans son nouveau lycée en Californie sont menacés par un autre étudiant qui a lui aussi un secret.
Niki et Micah quittent Las Vegas pour tenter de recommencer une nouvelle vie. Son nouveau travail mène Mohinder à poursuivre l'Haïtien. De leur côté, tandis qu'ils traversent le Mexique, les dons de Maya et Alejandro s'avèrent être une menace pour les personnes autour d'eux. Pendant ce temps, déçu par son héros Takezo Kensei, Hiro se décide à réparer tout dommage que sa présence dans le Japon féodal a pu causer à l'histoire. Enfin, un autre Heroes perdu, Peter, tombe sur un gang de bandits irlandais connaissant une partie de son passé.
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