Nom : Vaughn
Prénom : Michael
Lieu de résidence : Los Angeles
Taille : 1.839m
ID CIA : USS-CI-2300844
Nom de code : Boyscout, Shotgun
Famille : Fils de William "Bill" Vaughn. Marié à Sydney Bristow. Ex-femme Lauren Reed
Particularités : Parle couramment l'anglais, le français, l'espagnol et l'italien.

Vaughn est le fils d'une mère française et d'un père américain membre de la CIA. Alors qu'il n'a que 8 ans, son père est assassiné par un agent russe infiltré aux États Unis.

Vaughn est recruté par la CIA en 1994 où il deviendra ami avec Eric Weiss. Après deux années passées sur le territoire indien, Michael Vaughn devient l'agent intermédiaire de Sydney, chargé de lui faire part de ses contres-missions.Michael travaille pour la CIA et il est destiné à détruire le SD6 avec l'aide précieuse de Sydney.Lorsque l'agent vaughn fait part des contres missions à Sydney ils doivent se retrouver dans un hangar, puis lorsque la mission a été achevée ils se retrouvent dans divers endroits pour faire le point. Michael est aussi le confident de Sydney,malgré leur relation purement professionelle, elle le retrouve à chaques fois que tout va mal. Il apporte une certaine attention à son égard car il lui a même offert un cadre antique pour Noel dans un épisode de la saison 1. Dans cette même saison Michael ne participera que très rarement aux missions de Sydney, il reste en général à la CIA accompagné d'une oreillette reliée à celle de sydney et il l'aide à accomplir sa mission.
Au cours de la saison 1 Sydney ne prête pas particulièrement attention à Vaughn même si elle l'apprécie beaucoup alors que lui éprouve une certaine attirance.A la fin de la saison 1 l'agent Vaughn accompagne Sydney à Taipei pour une mission destinée à détruire une machine, seulement, lorsque la machine est détruite, le batiment où se trouvent les agents est inondé et ils doivent impérativement réussir à sortir de l'immeuble. Malheureusement l'agent vaughn ne sera pas assez rapide et restera coinçé malgré les tentatives de Sydney destinées à le sauver.

Dans la saison 2 l'agent Vaughn réapparaitra grâce à Sydney qui le retrouvera en France grâce à une de ses missions pour le SD6. L'agent Vaughn de retour à la CIA ne tardera pas à reprendre ses activités. Au cours de la saison 2 Michael et Sydney entretiendront des relations beaucoup plus intenses et subtiles que dans la saison 1 et vont même finir par sortir ensemble, d'ailleurs vous apercevrez leur 1er baiser dans l'épisode "phase1" et leur premier rapport sexuel dans l'épisode "trompe l'oeil".

Dans la saison 3 Sydney, portée disparue pendant 2 ans est de retour. Seulement ses relations avec l'agent Vaughn ne sont plus d'actualité car lui est maintenant marié à Lauren qui est en fait un agent ennemi, chose qu'il ignore totalement.
Michael est maintenant devenu professeur depuis la mort de Sydney, 2 ans auparavant, mais il ne tardera pas à reprendre ses activités au sein de la CIA. A la fin de la saison 3 l'agent Vaughn sera forcé de faire un choix entre sa femme sur qui il a tout découvert et Sydney et il sera contraint de tuer sa femme.

Dans la saison 4, il intègre l'APO aux côtés de Sydney. A la mort de son oncle, celui-ci lui remettra un carnet écrit par son père. Vaughn commencera à rechercher la vérité sur le passé de son père. Ses recherches lui prouve que son père est toujours en vie. Mais pour en savoir plus il est amené à trahir l'APO en dérobant un objet important lors d'une mission en Russie. Heureusement, il se rend compte qu'il a été manipulé par Sloane et après avoir fait son mea-culpa, il réintègre l'équipe afin de s'opposer à Sloane et Elena Derevko.

ALors qu'ils sont sur la route, Vaughn avoue à Sydney qu'il n'est pas celui qu'il prétend être mais un accident de voiture fera tourner court cette révélation. après cet accident, il sera enlevé mais réussira à s'échaper pour aller rejoindre Sydney à Rome où il se fera malheureusement abattre sous les yeux de Sydney. Mais tout ce ci n'est qu'un leur et Vaughn par en retraite au Bhoutan.
Il voudra quitter cette région afin d'épauler Sydney mais il se rendra vite compte qu'il n'est pas avec la vraie Sydney. Il mettra devant le fait accompli l'agent traitre lorsque celle-ci essaiera de le tuer. Sydney viendra à son secours en tuant l'agent.
Sydney et Vaughn se retruvent alors pour combattre leur ennemis : Prophet Cinq et Sloane qui en fait désormais parti.

Après avoir réussi à combattre cette organisation terroriste, Vaughn prend sa retraite aux côtés de Sydney et leurs enfants Isabelle et Jack.