Après que le sournois Agent du FBI Mitchel Loeb ait orchestré l'étrange évasion de David Robert Jones d'une prison allemande et de l'enlèvement d'Olivia, les indications d'une plus grande menace commence à apparaître.

En plus de ces évènements, un des anciens adversaires d'Olivia est appelé par la Division des Affaires Internes pour procéder à un examen formel de la Fringe Division et la soeur d'Olivia, Rachel, débarque chez cette dernière.

Le moment ne pouvait être plus inopportun, puisqu'Olivia, Peter et Walter courent contre le temps pour résoudre d'une manière extravagante le meurtre d'un grotesque mais estimé épidémiologiste avant qu'une épidémie catastrophique soit déclenchée. Cette affaire pourrait même être lier à l'enlèvement d'Olivia..